Essays about: "protein-ligand docking"

Found 4 essays containing the words protein-ligand docking.

  1. 1. Characterisation of Potential Inhibitors of Calmodulin from Plasmodium falciparum

    University essay from Linköpings universitet/Institutionen för fysik, kemi och biologi

    Author : Alexandra Iversen; Ebba Nordén; Julia Bjers; Filippa Wickström; Martin Zhou; Mohamed Hassan; [2020]
    Keywords : Plasmodium falciparum; Calmodulin; Malaria; Trifluoperazine; Calmidazolium; Artemisinin; Fentanyl derivatives; Modelling; Docking; Bioinformatics;

    Abstract : Each year countless lives are affected and about half a million people die from malaria, a disease caused by parasites originating from the Plasmodium family. The most virulent species of the parasite is Plasmodium falciparum (P. falciparum). READ MORE

  2. 2. Validation of docking performance in the context of a structural water molecule using model system

    University essay from Institutionen för fysik, kemi och biologi

    Author : Rickard Wahlström; [2009]
    Keywords : structural water molecules; docking; cytochrome C peroxidase; CCP W191G;

    Abstract : In silico ligand docking is a versatile and common technique when predicting ligands and inhibitors for protein binding sites. The various docking programmes aim to calculate binding energies and to predict interactions, thus identifying potential ligands. READ MORE

  3. 3. Protein Visualization and Haptics

    University essay from Institutionen för teknik och naturvetenskap

    Author : Joel Nises; [2008]
    Keywords : protein visualization; transparency sorting; haptics; rendering;

    Abstract : Applikationen Chemical Force Feedback (CFF) för haptisk och visuell molekylrendering som har utvecklats på Linköpings Universitet för att testa nyttan av haptik för undervisning av protein-ligand dockning för molekylär livsvetenskap behöver förbättras på ett antal punkter för att bättre kunna fungera som ett komplett molekylvisualiserings-verktyg. Tidigare projekt som utvecklat applikationen har fokuserat mestadels på den haptiska delen av programmet, vilket gjort att den visuella aspekten kommit efter. READ MORE

  4. 4. A fast protein-ligand docking method

    University essay from Institutionen för kommunikation och information

    Author : Samuel Genheden; [2006]
    Keywords : protein-ligand docking; molecular modelling; putative active sites ranking; fast Fourier transform;

    Abstract : In this dissertation a novel approach to protein-ligand docking is presented. First an existing method to predict putative active sites is employed. READ MORE