Molecular detection of luteovirus and polerovirus : in oat, broad bean, soybean and aphids

Abstract: Havre, åkerböna och sojabönor är alla vanliga och viktiga livsmedelsgrödor. De spelar en viktig roll över hela världen när det kommer till både näring och ekonomi. Liksom för de flesta växter kan de drabbas av olika sjukdomar, vilket orsakar ansenliga skördeförluster. Ett stort bekymmer är virusinfektioner i växter. Rödsotvirus (engelska barley yellow dwarf virus, BYDV), bean leafroll virus (BLRV) och besläktade virus tillhörande släktena luteovirus och polerovirus infekterar ofta ovan nämnda grödor. Symptom på infektion inkluderar missfärgning och dvärgväxt, och spridning sker främst med bladlöss som vektorer. Virusen som studeras i detta projekt har sitt genetiska material i form av RNA. Omvänd transkription och polymeraskedjereaktion (RT-PCR) utfördes för en nukleinsyrabaserad detektion av luteovirus och polerovirus i symptomatiska och asymptomatiska blad från ovan nämna växter, samt i bladlöss. Bladlössen samlades in på hösten år 2014 och 2020. Den stora mängden bladlöss dessa år orsakade omfattande virusspridning i stråsäd, och skador efterföljande år. Sekvenser med härkomst från virus påvisades inte i något av proven, inte heller den positiva kontrollen innehållande bladlöss med känd förekomst av BYDV. För bladlusprovet som fungerade som positiv kontroll så skulle en hög bakgrundsamplifiering kunna vara anledningen till frånvaron av identifierade virus-RNA-sekvenser. För växtproverna tros de negativa resultaten bero på att de inte var infekterade med luteovirus eller polerovirus. Resultaten från analyser av äldre bladlusprover indikerade inte någon förekomst av virus, men på grund av osäkra resultat kan inga säkra slutsatser dras. Fortsatt forskning på bladlöss kan leda till en ökad kännedom om korrelationen mellan den vektorburna virusöverföringen och virusepidemier i grödor. Denna kunskap kan i sin tur vara användbar i utformandet av riktlinjer av en precis användning av insekticider. Det skulle resultera i en säkrare skörd, reducerade ekonomiska förluster och en minskad miljöpåverkan.