Essays about: "kromatin"

Showing result 1 - 5 of 8 essays containing the word kromatin.

  1. 1. Chromatin accessibility analysis of spaceflight mouse brains using ArchR

    University essay from KTH/Genteknologi

    Author : Raphaël Mauron; [2023]
    Keywords : Single nuclei ATAC-sequencing; Space Biology; DNA Chromatin accessibility; Neurodegenerative; ArchR; ATAC-sekvensering av enskilda kärnor; rymdbiologi; tillgänglighet av DNA kromatin ; neurodegenerativa sjukdomar; ArchR;

    Abstract : Mänsklig utforskning av månen och Mars innebär stora utmaningar för människans fysiologi och hälsa på grund av de unika miljöfaktorer som följer av långvariga rymduppdrag. Rymdbiologiska experiment har blivit ett viktigt verktyg för att studera effekterna som mikrogravitation och rymdstrålning har på levande organismer, i syfte att förstå och minska dessa utmaningar. READ MORE

  3. 2. Investigation of Chromatin Organization and mRNA Expression in Drug Treated Human Erythroleukemia Cells

    University essay from KTH/Proteinvetenskap

    Author : Anam Minhas; [2022]
    Keywords : Erythroleukemia cells; mRNA-seq; ATAC-seq; Doxorubicin; Vinblastine; Erytroleukemiceller; mRNA-expression; kromatin; Doxorubicin; Vinblastine;

    Abstract : Syftet med detta projekt var att undersöka hur vanligt använda cancerläkemedel påverkar mRNA-uttryck och kromatinorganisation i humana erytroleukemiceller. Som modell användes K562-celler från en patient i blastocystkris (2), för att utvärdera leukemicellernas svar på cancerläkemedel vinblastin och doxorubicin. READ MORE

  4. 3. Exploring DeepSEA CNN and DNABERT for Regulatory Feature Prediction of Non-coding DNA

    University essay from KTH/Skolan för elektroteknik och datavetenskap (EECS)

    Author : Jacob Stachowicz; [2021]
    Keywords : Machine Learning; Computer Science; Bioinformatics; Genomics; Transformer; Natural Language Processing; Whole Genome Sequencing; Non-codingDNA; DeepSEA; CNN; DNABert; BERT; DanQ; Biomedical Science; Computational Biology; AuROC; AUPRC; Maskininlärning; Datavetenskap; Bioinformatik; Genomik; Transformer; Språkteknologi; Helgenomsekvensering; icke-kod DNA; DeepSEA; CNN; DNABert; BERT; DanQ; Biomedicinsk vetenskap; Beräkningsbiologi; AuROC; AUPRC;

    Abstract : Prediction and understanding of the regulatory effects of non-coding DNA is an extensive research area in genomics. Convolutional neural networks have been used with success in the past to predict regulatory features, making chromatin feature predictions based solely on non-coding DNA sequences. READ MORE

  5. 4. Epigenetic regulation of the Igf2/H19 gene cluster

    University essay from SLU/Dept. of Biomedical Sciences and Veterinary Public Health

    Author : Matilda Nordin; [2012]
    Keywords : Igf2; H19; epigenetik; prägling; metylering; kromatin;

    Abstract : Igf2 (insulin-lik tillväxtfaktor 2) och H19 är präglade gener hos däggdjur. Präglade gener uttrycks ojämnt; den allel som ärvts från den ena föräldern uttrycks mer än den från den andra. Igf2-genen kodar för en viktig embryonal tillväxtfaktor och uttrycks till protein bara från den paternella allelen. READ MORE

  6. 5. Chromatin functions : the DNA repair connection

    University essay from SLU/Dept. of Animal Breeding and Genetics

    Author : Jessica Pernerstål; [2012]
    Keywords : IGF2; H19 ICR; DNA repair; CTCF; ATM;

    Abstract : The aim of this master thesis was to examine a possible connection between chromatin functions and the DNA damage repair system, with the imprinted IGF2/H19 locus as a bait. Interactions can occur within and between chromosomes and it has been shown that H19 ICR on both alleles can communicate with alleles on other chromosomes. READ MORE